گستردگی طیف بیماری های عفونی به ویژه عفونت های انگلی و قارچی موجب گردیده که تحقیقات وسیعی برای کنترل و درمان این عفونت ها در جهان انجام شود. سنتز داروها و استخلاف های جدید، عصاره ها و اسانس های تهیه شده از گیاهان دارویی، رنگ های شیمیایی و سایر ترکیبات تولید شده به عنوان جایگزین داروهای قدیمی، از جمله مواردی است که نیاز به تعیین اثرات ضد میکروبی، انگلی و قارچی دارد. امروزه از روش های مولکولی و تست های تشخیصی مولکولار در جهت تشخیص عفونت ها، طبقه بندی و فیلوژنی عوامل بیماری زا، اپیدمیولوژی، حساسیت دارویی و سایر شاخه های تحقیقاتی استفاده می شود.
حیطه فعالیت های این مرکز عمدتاً در زمینه شناسایی، طبقه بندی ، فیلوژنی عوامل انگلی و قارچی، تشخیص عفونت های میکروبی، انگلی و قارچی ناشی از کرم ها، تک یاخته های خونی و نسجی، قارچ های کپکی، مخمری و بیماری زا و همچنین سایر عفونت های باکتریال به روش های معمول و مولکولار، تعیین مقاومت دارویی و بررسی اثرات ضد میکربی، انگلی و قارچی داروها، استخلاف ها و ترکیبات جدید دارویی، عصاره، اسانس، نانوپارتیکل ها و نهایتاً تهیه کیت های تشخیصی، تهیه آنتی ژن ها و آنتی بادی های اختصاصی و تهیه واکسن ها برای تشخیص و درمان این عفونت ها می باشد. مرکز تحقیقات علوم پایه در بیماری های عفونی، با رویکردی تازه سعی در پ‍ژوهش در زمینه های مختلف بیماری های عفونی و راه کارهای مختلف درمان آن ها دارد. این مرکز، متشکل از متخصصین انگل شناسی و قارچ شناسی بوده و با اساتید متخصص پوست و سایر مراکز تحقیقاتی و دانشکده های دامپزشکی، کشاورزی، داروسازی و دانشگاه علوم همکاری نزدیک دارد.
