محورهای اصلی فعالیت مرکز تحقیقات پایه در بیماری های عفونی شامل:
۱- مطالعات بیولوژیک، ژنومیک، اپیدمیک و فراساختاری بر روی انگل لیشمانیا و بیماری لیشمانیازیس.
۲- مطالعات بیولوژیک، ژنومیک، اپیدمیک و فراساختاری بر روی بیماری هیداتیدوز.
۳- بررسی اثرات ضد قارچی، انگلی و باکتریایی داروها متداول و جدید، مشتقات جدید دارویی، استخلاف ها، عصاره ها، ترکیبات سنتتیک، اسانس ها و سایر ترکیبات بدست آمده از گیاهان دارویی و مطالعات ژنومیک مقاومت دارویی
اهداف:
۱- انجام تحقیقات بنیادی در زمینه پاتوژنز بیماری های عفونی.
۹- همکاری با سایر سازمان ها و مراکز بهداشتی درمانی از جمله وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی و سازمان جهانی بهداشت در زمینه کنترل بیماری های قارچی و انگلی.
۱۲- تعیین حساسیت دارویی عوامل انگلی و قارچی (مخمرها و قارچ های رشته ای) نسبت به داروهای ضد رایج.
۱۳- کشت سلول و بررسی ارتباط و تقابل انگل ها و قارچ ها با میزبان.
۱۴- طراحی و تعیین نقشه تاکسونومی گونه های انگل های ایران و بررسی ارتباط فیلوژنی آنها با سایر نقاط جهان.
۱۵- مطالعه در زمینه پروتئینهای سطحی، ترشحی و ایزوآنزیمهای مختلف انگل ها و قارچ ها.
۱۶- معرفی و قرار دادن این مرکز در جایگاه ویژه به عنوان مرکز نمونه در زمینه تحقیقات انگل شناسی و قارچ شناسی در منطقه خاور میانه.
